Os objectivos específicos do Museu Municipal Carlos Reis são os seguintes:

• proceder ao registo, inventariação e classificação do seu acervo;
• manter actualizados todos os registos documentais referentes às novas incorporações do espólio museológico;
• conservar preventivamente o acervo museológico e zelar pela sua segurança;
• propor acções ou medidas de restauro das peças que formam as suas colecções;
• expor o acervo museológico com base na instalação de núcleos permanentes de colecções fixas;
• expor o acervo museológico, no âmbito dos programas de exposições temporárias superiormente definidos, bem como promover outras exposições temporárias tendo como base espólios particulares e criações artísticas individuais;
• divulgar o seu acervo museológico a partir da edição e venda de materiais [livros e brochuras, postais, réplicas, etc];
• promover a divulgação das suas actividades;
• estabelecer uma relação privilegiada com os estabelecimentos de ensino, a partir das suas actividades expositivas e outras;
• concretizar actividades de investigação nos domínios da museologia e do património, bem como enquadrar actividades arqueológicas no âmbito da intervenção do município neste domínio;
• concretizar acções de apoio técnico a outros museus da área do município, no âmbito de protocolos que venham a ser estabelecidos para o efeito.